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1、原因
烂豆芽是因为病毒侵染正常生长的豆芽所引起的。通常培育豆芽2-3天左右开始出现，一般在胚轴的底部或胚根的上部开始溃烂，然后逐渐扩大和蔓延，严重时使整个容器内的豆芽全部霉烂，造成很大的损失。引起烂豆芽的原因常见有：
--用水不清洁，水中含有机物多，常有致腐的细菌
--淋水不及时，不均匀引起
--培育豆芽的容器等未消毒干净，或者沾有油污
--豆种本身已发霉变质或带有病菌，还有些病虫粒和破瓣粒则不会发芽，亦容易腐烂，然后蔓延扩大
--气温变化无常，时冷时热，特别容易发生烂豆芽
--培育豆芽时温度过低，延长了预芽的天数，也容易导致病菌的侵染与蔓延，从而导致烂豆芽
--培育豆芽时的温度过高，而淋水时的水温又过低，也易造成烂豆芽。
2、克服措施
针对上述情况采取相应措施，防止烂豆芽：
①豆芽生产场地或厂房应及时消毒-----豆芽生产的厂房及器具应保持清洁，经常用消毒剂消毒。工厂内严禁堆放化肥、农药、柴油、油脂及其他化学药品，豆芽生产人员严禁解除油污、化学药品，不要用脂质润肤品、头油、化妆品等。饮酒后不要进入厂房内，防止细菌侵入。
②精选豆种-----选择籽粒饱满的豆种，剔除病粒、瘪粒，尤其是霉烂和破碎粒等。用0.2%的漂白粉溶液，5%石灰水或0.2%的小苏打等对豆种进行洗种，也可用热水烫种，有助于豆种表皮的消毒杀菌，同时可调整豆种发芽时酶的活性，提高发芽率，减少发病率。
③注意清洁卫生，及时清洗消毒器具----- 生产豆芽的容器及器具等，要经常保持清洁卫生，特别是对有腐斑的容器，要严格消毒，一般可用0.2%的漂白粉溶液，5%石灰水或0.2%的小苏打溶液清洗消毒，洗涤油污；亦可用开水煮汤、太阳暴晒等方法进行简易消毒。
④控制育芽温度-----要求室温理想保持在18度以上，25度以下，培育豆芽的温度不要低于20度，也不要超过28度，使豆芽生长在较合适的范围内，特别是气候冷热发生较大变化时，要用淋水的方法来调节与控制豆芽的温度，防止烂豆芽。每次淋水都要让全部豆芽淋透，使豆芽温度与水温趋于一致。科发豆芽机水箱容量大能充分保证淋水量，自动设定淋水间隔和淋水时间。
⑤水质要清洁-----用新鲜的井水或自来水，不能用富含有机物的水和化工污染的水质。
⑥淋浇水要适时-----一般每4小时淋水一次，但实际淋水次数、淋水量及水温等要根据豆芽容器内的干湿度、温度的高低及豆芽生长的不同阶段来确定。如夏季豆芽培育容器内的温度易升高，淋水的次数应增加，水的温度要低，淋水量也要加大。每次临水都要淋透、淋均匀。冬季则应用温水来浇淋。及时淋水可使豆芽新陈代谢后产生的废污物质及时排出。
⑦使用其他允许的消毒剂。
